PhD scholarships at DTU Nanotech
Technical University of Denmark
A number of PhD scholarships are available at the Department of Micro- and Nanotechnology, DTU Nanotech, starting in the summer/fall of 2011. The subject of the PhD project must be within one of the main research areas of the department:
Cleanroom based micro- and nanofabrication
Polymer micro- and nanoengineering
Synthesis and self assembly of nanostructures
Lab-on-a-chip technology
Diagnostics and drug delivery
Miniaturised sensor and energy technology
Nanobiotechnology
Theory of micro- and nanosystems
Qualifications
Candidates should have (or soon obtain) a master’s degree in or a similar degree with an equivalent academic level. Candidates may apply prior to obtaining their master’s degree, but cannot begin the PhD education before having received the grade.
To apply for these scholarships candidates must have an agreement with a supervisor at DTU Nanotech about a specified project. Therefore, for a candidate to be considered for the scholarships, endorsement and project description must be enclosed. See under “Application”.
Approval and Enrolment
The scholarships are subject to academic approval and the candidates will be enrolled in one of the PhD programmes at DTU. For information about the general requirements for enrolment and the general planning of the scholarship studies, please see the DTU PhD Guide.
Salary and appointment terms
The salary and appointment terms are consistent with the current rules for PhD students at DTU. The period of employment is 3 years.
DTU needs diversity and supports equal opportunities irrespective of gender, age, and ethnic back¬ground.
Application
We must have your online application by 13 May 2011 at the latest. Apply online at www.dtu.dk/career. Please open the link “apply for this job online”, fill in the application form and attach all of the following documents:
Curriculum vitae of the applicant including a list of publications(guidelines)
A letter motivating the application (guidelines)
Grade transcripts and BSc/MSc diploma
Conversion of grade averages to Danish grades (excel spreadsheet for the conversion)
Description of the proposed research project (guidelines) (to be attached under “Attach other relevant file”)
Endorsement by the DTU Nanotech supervisor (guidelines) (to be attached under “Attach other relevant file”)
Application Deadline: 13 May 2011
Further information is available at PhD at the Department of Micro- and Nanotechnology or by contacting senior consultant Anne Line Mikkelsen, phone +45 45255858, e-mail anne.line.mikkelsen(at)nanotech.dtu.dk.
DTU Nanotech – the Department of Micro- and Nanotechnology – is situated in the northern part of Copenhagen. DTU Nanotech is a centre of excellence in micro- and nanotechnology exploiting sciences across the traditional boundaries of technology, thereby enabling innovative solutions for the benefit of society. DTU Nanotech has approx. 200 people on its staff. With 40 % non-Danes, the department constitutes an international environment.
via: http://www.career.edu/index.php?post_id=8953
Dibaca akhir-akhir ini (Recent viewed)
Minggu, 22 Mei 2011
Slovak Government Scholarships for International Students, Slovak Republic
Slovak Government Scholarships for International Students, Slovak Republic
Scholarship Details: The provision of development aid of the Slovak Republic (SR) in the area of education takes the form of the award of scholarships of the Government of the SR that are consistent with the conditions approved by the Government Resolution No.344/2010 of 25 May 2010 for developing countries and for Slovaks living abroad, the Government Resolution No. 625/2008, of 17 September 2008, for academic year 2011/2012.
The official range of scholarship positions available is annually notified through the diplomatic offices of the SR abroad.
Under the development aid for the developing countries, the official offer is sent to the ministry of foreign affairs of the relevant country in accordance with the approved breakdown of countries and scholarship places in particular academic years.
Under the aid to Slovaks living abroad, the offer is sent to the official compatriot representatives according to the approved breakdown of countries and scholarship positions in relevant academic years.
Scholarship Application Deadline: 30 May 2011
Further Scholarship Information and Application
http://office.studyin.sk/grants/
Download Application for granting a scholarship – document in PDF format
http://office.studyin.sk/files/content/files/applicationGOV.pdf
Scholarship Details: The provision of development aid of the Slovak Republic (SR) in the area of education takes the form of the award of scholarships of the Government of the SR that are consistent with the conditions approved by the Government Resolution No.344/2010 of 25 May 2010 for developing countries and for Slovaks living abroad, the Government Resolution No. 625/2008, of 17 September 2008, for academic year 2011/2012.
The official range of scholarship positions available is annually notified through the diplomatic offices of the SR abroad.
Under the development aid for the developing countries, the official offer is sent to the ministry of foreign affairs of the relevant country in accordance with the approved breakdown of countries and scholarship places in particular academic years.
Under the aid to Slovaks living abroad, the offer is sent to the official compatriot representatives according to the approved breakdown of countries and scholarship positions in relevant academic years.
Scholarship Application Deadline: 30 May 2011
Further Scholarship Information and Application
http://office.studyin.sk/grants/
Download Application for granting a scholarship – document in PDF format
http://office.studyin.sk/files/content/files/applicationGOV.pdf
DIGESTI
Laporan Praktikum Genetika
DIGESTI (PEMOTONGAN DNA) DENGAN ENZIM RESTRIKSI
Faiq Anan M*), A.R. Junaid, D.C. Waluyo, D. Oktavia, N. Nikita, R. Guspratiwi, P.S. Pangestu
Universitas Indonesia
Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam
Departemen Biologi
Mei 2011
Abstrak
Digesti merupakan suatu metode pemotongan fragmen DNA menggunakan enzim restriksi. Pemotongan bertujuan mendapatkan suatu sekuens yang spesifik. Enzim restriksi dapat memotong secara spesifik fragmen-fragmen pada DNA. Hasil pemotongan dapat berupa ‘sticky’ dan ‘blunt’. Penamaan enzim restriksi menggunakan sebuah sistem nomenklatur sendiri. Telah dilakukan praktikum digesti (pemotongan fragmen DNA) dengan enzim restriksi. Jenis enzim restriksi yang digunakan adalah BanI. Hasil praktikum divisualisasi dalam geldoc yang sebelumnya dielektroforesis terlebih dahulu. Terlihat band yang telah dipotong oleh enxim restriksi.
.
Kata kunci: Enzim restriksi, sticky end, digesti
1. Pendahuluan
DNA hasil isolasi masih berupa sekuens yang panjang dengan fragmen-fragmen yang masih saling berikatan. Pemotongan dengan suatu enzim pada DNA tersebut dilakukan untuk menghasilkan sekuens DNA tertentu yang spesifik. Enzim restriksi dapat mengenali situs penganalan pada DNA secara spesifik dan memotongnya secara spesifik.
Digesti merupakan proses pemotongan fragmen DNA dengan menggunakan suatu enzim khusus yaitu enzim restriksi. Enzim restriksi yang digunakan yaitu enzim restriksi endonuklease yang akan mengenali dan memotong fragmen DNA pada sekuen yang spesifik. Fragmen yang dipotong akan digabungkan dengan suatu fragmen DNA lain yang berperan sebagai vektor. Vektor merupakan molekul DNA yang dapat bereplikasi secara autonom yang akan memfasilitasi proses manipulasi dan identifikasi molekul DNA rekombinan yang terbentuk (Klug & Cummings 1994: 383).
Prinsip dasar dari teknologi DNA rekombinan adalah sebuah golongan enzim yang disebut restriksi endonuklease. Enzim ini diisolasi dari bakteri, diperoleh dari namanya karena mereka membatasi atau mencegah infeksi virus dengan memotong asam nukleat yang datang. Enzim restriksi mengenal sebuah sekuen nukleotida spesifik dan menghasilkan suatu kerusakan dobel helix di dalam atau di dekat dari sekuens (Klug & Cummings 1994 : 384).
Situs pemotongan enzim restriksi terdapat dua macam, yaitu di dalam lokus dan di tepi lokus, atau bisanya disebut eksonuklease dan endonuklease. Sedangkan hasil pemotongan terdapat dua yaitu, blunt end dan sticky end. Blunt end menghasilkan hasil akhir pemotongan yang tumpul, sedangkan pada sticky end menghasilkan pemotongan yang lancip. Pemotongan blunt end menghasilkan masalah ketika dicoba untuk diklonkan. Hal ini berbeda dengan hasil sticky end yang lebih efisien (Reece 2004: 187--188). Pemotongan enzim restriksi yang dapat menghasilkan ujung yang dinamakan “sticky” yang dapat saling menempel antara ujung DNA satu dengan ujung DNA yang lain. Kedua DNA dengan ujung sticky jika ditempatkan pada kondisi yang tepat, maka dapat membentuk molekul rekombinan dengan menempelkan kedua ujungnya. Penempelan kedua ujung dibantu oleh enzim ligase (Klug & Cummings 1994: 384).
Dua jenis enzim erestriksi endonuklease telah ditemukan, dan lebih dari 80 enzim dari ketiga tipe sudah dikenali. Enzim restriksi tipe I mengenali suatu DNA pada suatu lokasi secara acak pada beberapa jarak dari situs pengenalannya. Enzim restriksi tipe II mengenali suatu sekuens spesifik dan memotong dengan tepat kedua untai di dalam sekuens. Enzim restriksi tipe II ini, situs pengenalannya berupa palindromik yang membaca secara sama arah 5’ ke 3’ pada untai komplementer. Tipe III enzim restriksi mengenali urutan DNA yang spesifik dan memotong di dekat situs pengenalannya, biasanya sekitar 25 bp. Dari 3 jenis, enzim tipe II yang sering digunakan pada genetic engineering. Satu diantara enzim yang ditemukan berasal dari E. coli dan telah diberi nama ECoR1 (Klug & Cummings 1994 : 384 ; Pierce. 2002: 510).
Nomenklatur enzim restriksi berasal dari tiga huruf pertama dari singkatan untuk setiap enzim restriksi mengacu pada spesies bakteri dari mana enzim diisolasi (misalnya, Eco mengacu pada E. coli). Huruf keempat dapat merujuk pada strain bakteri dari mana enzim diisolasi (huruf "R" dalam EcoRI menunjukkan bahwa enzim ini diisolasi dari RY13 strain E. coli). Angka Romawi yang mengikuti huruf memungkinkan enzim berbeda dari spesies yang sama untuk diidentifikasi. Untuk kenyamanan, ahli genetika molekuler telah menyebutksn dengan istimewa pengucapan nama-nama tersebut, misal : EcoRI dilafalkan "echo-R-one," adalah HindIII "hin-D-three," dan HaeIII adalah "hae-three." lafal ini umum tidak mematuhi aturan-aturan formal dan hanya harus dipelajari (Pierce. 2002: 511).
Perkembangan teknik-teknik biologi molekular, salah satunya menciptakan teknik digesti yang dapat diaplikasikan dalam penelitian genetik serta mempermudah dalam mendapatkan DNA yang mengkode gen spesifik dalam jumlah besar. Selain itu, digesti merupakan salah satu teknik yang mendukung studi ekspresi, struktur, dan organisasi gen. Metode tersebut juga mendukung perkembangan industri bioteknologi yang telah menghasilkan banyak produk di tingkat pasaran (Klug & Clummings 1994: 384).
Praktikum digesti (pemotongan fragmen DNA) dengan enzim restriksi dilakukan dengan tiga tujuan. Pertama, mengetahui pengertian dan prinsip kerja digesti. Kedua, memahami dan mengetahui fungsi enzim restriksi. Ketiga, mengetahui aturan nomenklatur enzim restriksi..
2. Metodologi
Praktikum digesti (pemotongan fragmen DNA) dengan enzim restriksi menggunakan alat-alat dan bahan-bahan tertentu. Alat-alat yang digunakan pada praktikum Digesti (pemotongan DNA) dengan enzim restriksi yaitu, mikropipet, tube, sarung tangan, tabung 1,5 ml, kotak es dan inkubator. Bahan-bahan yang digunakan yaitu, enzim BanI 20 U/μl, Buffer NE4 10x, Nuclease free water, sampel DNA darah.
Cara kerja yang dilakukan yaitu pertama reaction mixture dimasukkan ke dalam tube. Reaction mixture berisi enzim BanI 0,5 μl, Buffer NE4 10x 1,2 μl, Nuclease free water 3,65 μl dan amplikon 10 μl. Kedua, tube diinkubasi selama empat jam pada suhu 37oC. Ketiga, hasil inkubasi dielektrolisis kemudian hasilnya divisualisasi pada geldoc.
3. Hasil Pengamatan
Hasil yang diperoleh pada praktikum digesti fragmen DNA dengan enzim restriksi yaitu visualisasi gel doc hasil digesti yang dapat dilihat pada gambar berikut.
4. Pembahasan
Enzim restriksi yang digunakan dalam praktikum yaitu enzim BanI U/µl. Enzim tersebut berasal dari bakteri Bacillus aneurinolyticus (IAM 1077). Panjang sekuensnya 354 AA dan berfungsi dalam molekular sebagai endonuklease, hydrolase dan nuklease. Marka yang digunakan dalam praktikum yaitu Marker Øx/HaeIII. Jenis marka tersebut memiliki dua tipe yaitu N3026L dan N3026S. marka N3026L memiliki ukuran 250 gel lanes dengan konsentrasi 1000 mg/µl. Marka N3026S memiliki ukuran gel lanes dengan konsentrasi 1000 mg/µl.
Berdasarkan hasil visualisasi dapat ditentukan ukruan berat suatu protein dengan menggunakan marka. Semua sampel dari kelompok 1B sampai kelompok 5B memiliki dua band yang spesifik yaitu ukuran antara 118b--194bp dan 234 bp. Sedangkan sampel kelompok 6B hanya mempunyaiampel satu band yang berukuran antara 310bp--603bp.
Berdasarkan literatur, proses digesti diawali dengan pengenalan fragmen DNA sampel pada sekuen yang spesifik oleh enzim restriksi, dalam hal ini enzim restriksi endonuklease. Fragmen kemudian bergabung dengan molekul DNA lain yang berperan sebagai vektor. Vektor terserbut dapat melakukan replikasi secara autonom atau mandiri dan membantu proses pembentukan molekul DNA rekombinan. Vektor kemudian dimasukkan ke dalam host cell, tempat dihasilkan kopian fragmen DNA yang dinamakan Clones. Clones merupakan molekul DNA rekombinan yang mengandung vektor dan fragmen DNA sampel yang telah mengalami replikasi. Clones kemudian diisolasi dari host cell, dipurifikasi, dan dianalisis (Klug & Cummings 1994: 383).
Proses digesti menggunakan larutan nuclease free water, larutan ini digunakan sebagai pelarut dari semua bahan-bahan. Kemudian Buffer NE4 10x, larutan ini digunakan untuk menjaga pH larutan selama proses digesti. Selain itu juga digunakan enzim BanI yang akan mengenali dan memotong fragmen DNA sampel pada sekuen yang spesifik.
5. Kesimpulan
Kesimpulan yang didapat praktikan dari praktikum digesti (pemotongan fragmen DNA) dengan enzim restriksi yaitu :
1. Digesti merupakan proses pemotongan DNA menggunakan enzim restriksi.
2. Enzim restriksi merupakan suatu enzim yang dapat memotong secara spesifik sekuens tertentu pada suatu DNA.
3. Penamaan enzim restriksi berdasarkan nama bekteri yang digunakan, baik nama genus maupun nama spesies, nama strain bakteri dan nomor bakteri tersebut digunakan sebagai bahan pembuatan enzim.
6. Daftar Pustaka
Klug, W. S. & M. R. Cummings. 1994. Concept of genetics. 4th Ed. Prentice Hall, Englewood cliffs: xvi + 779 hlm.
Pierce, B.A., GENETICS: A Conceptual approach, 3th Ed. 2002. Paperback: xxv + 711 hlm.
Reece,.J.R.2004.Analysis of genes and genomes.J.H. Willey & Sons : xvii + 459 hlm.
DIGESTI (PEMOTONGAN DNA) DENGAN ENZIM RESTRIKSI
Faiq Anan M*), A.R. Junaid, D.C. Waluyo, D. Oktavia, N. Nikita, R. Guspratiwi, P.S. Pangestu
Universitas Indonesia
Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam
Departemen Biologi
Mei 2011
Abstrak
Digesti merupakan suatu metode pemotongan fragmen DNA menggunakan enzim restriksi. Pemotongan bertujuan mendapatkan suatu sekuens yang spesifik. Enzim restriksi dapat memotong secara spesifik fragmen-fragmen pada DNA. Hasil pemotongan dapat berupa ‘sticky’ dan ‘blunt’. Penamaan enzim restriksi menggunakan sebuah sistem nomenklatur sendiri. Telah dilakukan praktikum digesti (pemotongan fragmen DNA) dengan enzim restriksi. Jenis enzim restriksi yang digunakan adalah BanI. Hasil praktikum divisualisasi dalam geldoc yang sebelumnya dielektroforesis terlebih dahulu. Terlihat band yang telah dipotong oleh enxim restriksi.
.
Kata kunci: Enzim restriksi, sticky end, digesti
1. Pendahuluan
DNA hasil isolasi masih berupa sekuens yang panjang dengan fragmen-fragmen yang masih saling berikatan. Pemotongan dengan suatu enzim pada DNA tersebut dilakukan untuk menghasilkan sekuens DNA tertentu yang spesifik. Enzim restriksi dapat mengenali situs penganalan pada DNA secara spesifik dan memotongnya secara spesifik.
Digesti merupakan proses pemotongan fragmen DNA dengan menggunakan suatu enzim khusus yaitu enzim restriksi. Enzim restriksi yang digunakan yaitu enzim restriksi endonuklease yang akan mengenali dan memotong fragmen DNA pada sekuen yang spesifik. Fragmen yang dipotong akan digabungkan dengan suatu fragmen DNA lain yang berperan sebagai vektor. Vektor merupakan molekul DNA yang dapat bereplikasi secara autonom yang akan memfasilitasi proses manipulasi dan identifikasi molekul DNA rekombinan yang terbentuk (Klug & Cummings 1994: 383).
Prinsip dasar dari teknologi DNA rekombinan adalah sebuah golongan enzim yang disebut restriksi endonuklease. Enzim ini diisolasi dari bakteri, diperoleh dari namanya karena mereka membatasi atau mencegah infeksi virus dengan memotong asam nukleat yang datang. Enzim restriksi mengenal sebuah sekuen nukleotida spesifik dan menghasilkan suatu kerusakan dobel helix di dalam atau di dekat dari sekuens (Klug & Cummings 1994 : 384).
Situs pemotongan enzim restriksi terdapat dua macam, yaitu di dalam lokus dan di tepi lokus, atau bisanya disebut eksonuklease dan endonuklease. Sedangkan hasil pemotongan terdapat dua yaitu, blunt end dan sticky end. Blunt end menghasilkan hasil akhir pemotongan yang tumpul, sedangkan pada sticky end menghasilkan pemotongan yang lancip. Pemotongan blunt end menghasilkan masalah ketika dicoba untuk diklonkan. Hal ini berbeda dengan hasil sticky end yang lebih efisien (Reece 2004: 187--188). Pemotongan enzim restriksi yang dapat menghasilkan ujung yang dinamakan “sticky” yang dapat saling menempel antara ujung DNA satu dengan ujung DNA yang lain. Kedua DNA dengan ujung sticky jika ditempatkan pada kondisi yang tepat, maka dapat membentuk molekul rekombinan dengan menempelkan kedua ujungnya. Penempelan kedua ujung dibantu oleh enzim ligase (Klug & Cummings 1994: 384).
Dua jenis enzim erestriksi endonuklease telah ditemukan, dan lebih dari 80 enzim dari ketiga tipe sudah dikenali. Enzim restriksi tipe I mengenali suatu DNA pada suatu lokasi secara acak pada beberapa jarak dari situs pengenalannya. Enzim restriksi tipe II mengenali suatu sekuens spesifik dan memotong dengan tepat kedua untai di dalam sekuens. Enzim restriksi tipe II ini, situs pengenalannya berupa palindromik yang membaca secara sama arah 5’ ke 3’ pada untai komplementer. Tipe III enzim restriksi mengenali urutan DNA yang spesifik dan memotong di dekat situs pengenalannya, biasanya sekitar 25 bp. Dari 3 jenis, enzim tipe II yang sering digunakan pada genetic engineering. Satu diantara enzim yang ditemukan berasal dari E. coli dan telah diberi nama ECoR1 (Klug & Cummings 1994 : 384 ; Pierce. 2002: 510).
Nomenklatur enzim restriksi berasal dari tiga huruf pertama dari singkatan untuk setiap enzim restriksi mengacu pada spesies bakteri dari mana enzim diisolasi (misalnya, Eco mengacu pada E. coli). Huruf keempat dapat merujuk pada strain bakteri dari mana enzim diisolasi (huruf "R" dalam EcoRI menunjukkan bahwa enzim ini diisolasi dari RY13 strain E. coli). Angka Romawi yang mengikuti huruf memungkinkan enzim berbeda dari spesies yang sama untuk diidentifikasi. Untuk kenyamanan, ahli genetika molekuler telah menyebutksn dengan istimewa pengucapan nama-nama tersebut, misal : EcoRI dilafalkan "echo-R-one," adalah HindIII "hin-D-three," dan HaeIII adalah "hae-three." lafal ini umum tidak mematuhi aturan-aturan formal dan hanya harus dipelajari (Pierce. 2002: 511).
Perkembangan teknik-teknik biologi molekular, salah satunya menciptakan teknik digesti yang dapat diaplikasikan dalam penelitian genetik serta mempermudah dalam mendapatkan DNA yang mengkode gen spesifik dalam jumlah besar. Selain itu, digesti merupakan salah satu teknik yang mendukung studi ekspresi, struktur, dan organisasi gen. Metode tersebut juga mendukung perkembangan industri bioteknologi yang telah menghasilkan banyak produk di tingkat pasaran (Klug & Clummings 1994: 384).
Praktikum digesti (pemotongan fragmen DNA) dengan enzim restriksi dilakukan dengan tiga tujuan. Pertama, mengetahui pengertian dan prinsip kerja digesti. Kedua, memahami dan mengetahui fungsi enzim restriksi. Ketiga, mengetahui aturan nomenklatur enzim restriksi..
2. Metodologi
Praktikum digesti (pemotongan fragmen DNA) dengan enzim restriksi menggunakan alat-alat dan bahan-bahan tertentu. Alat-alat yang digunakan pada praktikum Digesti (pemotongan DNA) dengan enzim restriksi yaitu, mikropipet, tube, sarung tangan, tabung 1,5 ml, kotak es dan inkubator. Bahan-bahan yang digunakan yaitu, enzim BanI 20 U/μl, Buffer NE4 10x, Nuclease free water, sampel DNA darah.
Cara kerja yang dilakukan yaitu pertama reaction mixture dimasukkan ke dalam tube. Reaction mixture berisi enzim BanI 0,5 μl, Buffer NE4 10x 1,2 μl, Nuclease free water 3,65 μl dan amplikon 10 μl. Kedua, tube diinkubasi selama empat jam pada suhu 37oC. Ketiga, hasil inkubasi dielektrolisis kemudian hasilnya divisualisasi pada geldoc.
3. Hasil Pengamatan
Hasil yang diperoleh pada praktikum digesti fragmen DNA dengan enzim restriksi yaitu visualisasi gel doc hasil digesti yang dapat dilihat pada gambar berikut.
4. Pembahasan
Enzim restriksi yang digunakan dalam praktikum yaitu enzim BanI U/µl. Enzim tersebut berasal dari bakteri Bacillus aneurinolyticus (IAM 1077). Panjang sekuensnya 354 AA dan berfungsi dalam molekular sebagai endonuklease, hydrolase dan nuklease. Marka yang digunakan dalam praktikum yaitu Marker Øx/HaeIII. Jenis marka tersebut memiliki dua tipe yaitu N3026L dan N3026S. marka N3026L memiliki ukuran 250 gel lanes dengan konsentrasi 1000 mg/µl. Marka N3026S memiliki ukuran gel lanes dengan konsentrasi 1000 mg/µl.
Berdasarkan hasil visualisasi dapat ditentukan ukruan berat suatu protein dengan menggunakan marka. Semua sampel dari kelompok 1B sampai kelompok 5B memiliki dua band yang spesifik yaitu ukuran antara 118b--194bp dan 234 bp. Sedangkan sampel kelompok 6B hanya mempunyaiampel satu band yang berukuran antara 310bp--603bp.
Berdasarkan literatur, proses digesti diawali dengan pengenalan fragmen DNA sampel pada sekuen yang spesifik oleh enzim restriksi, dalam hal ini enzim restriksi endonuklease. Fragmen kemudian bergabung dengan molekul DNA lain yang berperan sebagai vektor. Vektor terserbut dapat melakukan replikasi secara autonom atau mandiri dan membantu proses pembentukan molekul DNA rekombinan. Vektor kemudian dimasukkan ke dalam host cell, tempat dihasilkan kopian fragmen DNA yang dinamakan Clones. Clones merupakan molekul DNA rekombinan yang mengandung vektor dan fragmen DNA sampel yang telah mengalami replikasi. Clones kemudian diisolasi dari host cell, dipurifikasi, dan dianalisis (Klug & Cummings 1994: 383).
Proses digesti menggunakan larutan nuclease free water, larutan ini digunakan sebagai pelarut dari semua bahan-bahan. Kemudian Buffer NE4 10x, larutan ini digunakan untuk menjaga pH larutan selama proses digesti. Selain itu juga digunakan enzim BanI yang akan mengenali dan memotong fragmen DNA sampel pada sekuen yang spesifik.
5. Kesimpulan
Kesimpulan yang didapat praktikan dari praktikum digesti (pemotongan fragmen DNA) dengan enzim restriksi yaitu :
1. Digesti merupakan proses pemotongan DNA menggunakan enzim restriksi.
2. Enzim restriksi merupakan suatu enzim yang dapat memotong secara spesifik sekuens tertentu pada suatu DNA.
3. Penamaan enzim restriksi berdasarkan nama bekteri yang digunakan, baik nama genus maupun nama spesies, nama strain bakteri dan nomor bakteri tersebut digunakan sebagai bahan pembuatan enzim.
6. Daftar Pustaka
Klug, W. S. & M. R. Cummings. 1994. Concept of genetics. 4th Ed. Prentice Hall, Englewood cliffs: xvi + 779 hlm.
Pierce, B.A., GENETICS: A Conceptual approach, 3th Ed. 2002. Paperback: xxv + 711 hlm.
Reece,.J.R.2004.Analysis of genes and genomes.J.H. Willey & Sons : xvii + 459 hlm.
Karawitan Jawa Sejajar dengan Musik Klasik Barat
Karawitan Jawa Sejajar dengan Musik Klasik Barat
Surakarta, CyberNews. Tak disangkal lagi, karawitan Jawa sudah menembus lapisan masyarakat internasional. Tak hanya unsur estetik musikal, namun terkandung nilai unik, keberagaman, toleransi, demokrasi, kemerdekaan, dan unsur universal lainnya. Faktor itu membuat karawitan terdorong mendunia.
''Pakar musik asing terus mengkaji dari berbagai sisi, dan menyebarkannya ke seluruh dunia. Ketertarikan itu merupakan sebuah pengakuan kesetaraan kualitas karawitan dengan musik barat. Derajat keklasikan karawitan sejajar dengan musik klasik barat,'' kata Prof DR Waridi SKar MHum dalam pidato pengukuhannya sebagau guru besar Ilmu Karawitan di Institut Seni Indonesia (ISI) Surakarta, Rabu (15/11).
Pidato pengukuhan diselingi dengan iringan berbagai gending, untuk menunjukan beberapa cirikhas perkembangan karawitan Jawa.
Dia mencontohkan, saat ini di Amerika terdapat lebih dari 200 perangkat gamelan jawa. Juga di Inggris, Belanda, Australia, Jepang, Jerman, New Zeland, yang punya puluhan perangkat. Secara intensif gamelan dipelajari tidak sekadar sebagai alat musik, namun juga dari sisi teori dan keilmuan.
''Malah akhir-akhir ini gamelan sudah mengalir ke negeri Cina, Skotlandia, Austria, dan negara-negara Eropa Timur. Itu semua merupakan jalan panjang yang dilewati secara dinamis, sesuai dengan dinamika sosial dan budaya masyarakat. Karawitan pun tampil sebagai multifaced (banyak ragam), yang memiliki dimensi multi,'' tandas dia.
Derajat keklasikan karawitan tidak saja terkait dengan perjalanan waktu, namun berhubungan dengan kualitas musikal, sistem dan organisasi, orkestrasi, instrumentasi, kandungan nilai-nilai dan fungsinya yang membudaya di tengah masyarakat.
Dari sisi keilmuan, Ilmu Karawitan tumbuh sejak jaman penjajahan. Sejumlah peneliti asing mengkaji dari sisi teoritik. Misalnya Jaap Kunts yang memulai studi ilmu tersebut pada tahun 1920. Disusul Mantel Hood pada tahun 1954. Meski tidak sempurna, karena lebih merupakan penelitian teoritik, namun diakui etnomusikologi asing itu memelopori terbukanya kajian secara ilmiah karawitan.
''Kajian intensif dimulai oleh para ahli karawitan, sejalan dengan lahirnya berbagai perguruan tinggi dan sekolah karawitan di Indonesia. Ada Ki Martopengrawit yang juga pendiri serta dosen di ASKI (Akademi Seni Karawitan Indonesia) Surakarta, yang dilanjutkan dengan para muridnya seperti Prof Sumarsam SKar, Prof DR Rahayu Supanggah SKar, Prof DR Sri Hastanto SKar,'' kata dia.
Dari perkembangan penciptaan, yang juga dipelopori Martopengrawit, juga muncul Tjokrowasito, dan Ki Narto Sabdo yang sangat fenomenal karena keberaniannya menciptakan terobosan dalam penciptaan dan keberagaman karawitan. Masing-masing memiliki dan mengembangkan cirikhas yang sangat menonjol dalam penciptaan gending.
''Martopengrawit dipengaruhi kondisi sosial dan budaya, Tjokrowasito condong pada pengaruh perpolitikan sehingga muncul gending kritik sosial. Narto Sabdo didukung dengan kemampuan kesenimanan mampu menerobos berbagai ranah kehidupan.''
Yang pasti, dengan perkembangan tersebut, sudah waktunya karawitan berdiri sendiri sebagai sebuah ilmu, bukan berteduh di bawah bendera ilmu lain.( joko dwi hastanto/Cn08 )
dari Suara Merdeka Cyber News
Surakarta, CyberNews. Tak disangkal lagi, karawitan Jawa sudah menembus lapisan masyarakat internasional. Tak hanya unsur estetik musikal, namun terkandung nilai unik, keberagaman, toleransi, demokrasi, kemerdekaan, dan unsur universal lainnya. Faktor itu membuat karawitan terdorong mendunia.
''Pakar musik asing terus mengkaji dari berbagai sisi, dan menyebarkannya ke seluruh dunia. Ketertarikan itu merupakan sebuah pengakuan kesetaraan kualitas karawitan dengan musik barat. Derajat keklasikan karawitan sejajar dengan musik klasik barat,'' kata Prof DR Waridi SKar MHum dalam pidato pengukuhannya sebagau guru besar Ilmu Karawitan di Institut Seni Indonesia (ISI) Surakarta, Rabu (15/11).
Pidato pengukuhan diselingi dengan iringan berbagai gending, untuk menunjukan beberapa cirikhas perkembangan karawitan Jawa.
Dia mencontohkan, saat ini di Amerika terdapat lebih dari 200 perangkat gamelan jawa. Juga di Inggris, Belanda, Australia, Jepang, Jerman, New Zeland, yang punya puluhan perangkat. Secara intensif gamelan dipelajari tidak sekadar sebagai alat musik, namun juga dari sisi teori dan keilmuan.
''Malah akhir-akhir ini gamelan sudah mengalir ke negeri Cina, Skotlandia, Austria, dan negara-negara Eropa Timur. Itu semua merupakan jalan panjang yang dilewati secara dinamis, sesuai dengan dinamika sosial dan budaya masyarakat. Karawitan pun tampil sebagai multifaced (banyak ragam), yang memiliki dimensi multi,'' tandas dia.
Derajat keklasikan karawitan tidak saja terkait dengan perjalanan waktu, namun berhubungan dengan kualitas musikal, sistem dan organisasi, orkestrasi, instrumentasi, kandungan nilai-nilai dan fungsinya yang membudaya di tengah masyarakat.
Dari sisi keilmuan, Ilmu Karawitan tumbuh sejak jaman penjajahan. Sejumlah peneliti asing mengkaji dari sisi teoritik. Misalnya Jaap Kunts yang memulai studi ilmu tersebut pada tahun 1920. Disusul Mantel Hood pada tahun 1954. Meski tidak sempurna, karena lebih merupakan penelitian teoritik, namun diakui etnomusikologi asing itu memelopori terbukanya kajian secara ilmiah karawitan.
''Kajian intensif dimulai oleh para ahli karawitan, sejalan dengan lahirnya berbagai perguruan tinggi dan sekolah karawitan di Indonesia. Ada Ki Martopengrawit yang juga pendiri serta dosen di ASKI (Akademi Seni Karawitan Indonesia) Surakarta, yang dilanjutkan dengan para muridnya seperti Prof Sumarsam SKar, Prof DR Rahayu Supanggah SKar, Prof DR Sri Hastanto SKar,'' kata dia.
Dari perkembangan penciptaan, yang juga dipelopori Martopengrawit, juga muncul Tjokrowasito, dan Ki Narto Sabdo yang sangat fenomenal karena keberaniannya menciptakan terobosan dalam penciptaan dan keberagaman karawitan. Masing-masing memiliki dan mengembangkan cirikhas yang sangat menonjol dalam penciptaan gending.
''Martopengrawit dipengaruhi kondisi sosial dan budaya, Tjokrowasito condong pada pengaruh perpolitikan sehingga muncul gending kritik sosial. Narto Sabdo didukung dengan kemampuan kesenimanan mampu menerobos berbagai ranah kehidupan.''
Yang pasti, dengan perkembangan tersebut, sudah waktunya karawitan berdiri sendiri sebagai sebuah ilmu, bukan berteduh di bawah bendera ilmu lain.( joko dwi hastanto/Cn08 )
dari Suara Merdeka Cyber News
Minggu, 15 Mei 2011
Ebook baru (path I)
Hai hai pengunjung firillium chromanidas yang berbahagia...
Ada postingan keren nih...bagi pembaca novel setia, silakan download filenya
* Muhassabah cinta seorang istri karya Asma Nadia download disini
* Biology Premier On Molecular Genetics download disini
* Laa Tahzan download disini
* Setelah Kau Menikahiku download disini
* Senja Kapas-kapas di langit karya Pipit download disini
* Abu Nawas sang Penggeli Hati download disini
Selamat mendownload dan membacanya...:)
Ada postingan keren nih...bagi pembaca novel setia, silakan download filenya
* Muhassabah cinta seorang istri karya Asma Nadia download disini
* Biology Premier On Molecular Genetics download disini
* Laa Tahzan download disini
* Setelah Kau Menikahiku download disini
* Senja Kapas-kapas di langit karya Pipit download disini
* Abu Nawas sang Penggeli Hati download disini
Selamat mendownload dan membacanya...:)
Langganan:
Postingan (Atom)